A finales de este año dieron comienzo las obras en el antiguo Convento del Carmen,  que duraría tres años. El 1 de julio de 1913 llegaban los primeros Salesianos a Alcalá. La primera Comunidad estaba compuesta por seis Salesianos: Don Agustín Nofre, Don Antonio Torrero, Don Cayetano Vela, Don Juan Salazar, Don Luis Primitivo y Don José Novoa.

El primer Director fue don Agustín M. Nofre (1913-1919). Había que organizar el curso escolar, daría comienzo el Oratorio Festivo y se alojarían los primeros internos en el colegio. Al principio había cinco clases, tres de ellas eran gratuitas. El Colegio se inaugura con el nombre de Nuestra señora del Carmen.

En 1914 el Rectorado de la Universidad Literaria de Sevilla daba su conformidad sobre la apertura legal de este colegio religioso.

Antes de terminar el mandato de don Agustín Nofre, se produce una triste noticia, el 12 de junio de 1916, Doña Virginia Belloc fallece.

A Don Agustín Nofre le sucedió Don Fernando García (1919-1923), que consigue que el Colegio fuera reconocido de forma oficial por parte del Estado en octubre de 1916.

Durante la dirección de Don Manuel Fernández (1923-1926) se recibe la visita del Rector Mayor, Don Felipe Rinaldi.

Con Don Antonio Torrero Luque (1927-1934), la Casa sigue su marcha con paso firme, ampliando y modernizando distintas dependencias del Colegio.

Durante estos años y ante el cariz que estaban tomado los acontecimientos tras la proclamación de la II República, se formaliza la Escolar Mutua Alcalareña, para hacer frente a las nuevas disposiciones educativas del Gobierno, que impedían a los religiosos impartir clases. Como gran acontecimiento de este mandato, destaca la canonización de Don Bosco en 1934.

Don Rafael Tormo García (1934-1939), tiene que hacer frente a los últimos y difíciles años de la República y a los primeros días de la Guerra Civil, durante la cual, esta Casa Salesiana, sufre «violenta persecución en personas y haberes».

Días trágicos, la Casa es asaltada en julio de 1936. La Iglesia fue incendiada, quedando sin techo, sin altares ni ornamentos, sin imágenes, y con los muros calcinados.

Después de estos tristes sucesos, la comunidad Salesiana tiene que comenzar de nuevo. El Colegio se hallaba totalmente destruido, en aquel verano, muchos alumnos y antiguos alumnos se prestaron para intervenir en las tareas de recuperación y desescombro. El 1 de octubre de ese mismo año puede comenzar el curso y seguir así proporcionando enseñanza gratis a los alcalareños.

Don Francisco Javier Montero (1939-1945) inicia la reconstrucción del Colegio, que se encontraba en un lamentable estado. Se amplía el número de clases y la oferta educativa, implantándose el Bachillerato Elemental, creando la residencia para internado.

A partir de este momento el Colegio pasa a llamarse de Nuestra Señora del Águila, en honor a la patrona de Alcalá de Guadaíra. La Capilla se bendice en diciembre de 1940.

Los dos directores siguientes, Don Serafín García Hernández (1945-1947) y Don José Ruiz Olmo (1947- 1950) continúan con las obras de restauración de Colegio y el resto de la Casa.

Los siguientes directores fueron: Don Pacífico Medina (1950-1952), Don Silverio Barrera (1952-1953), Don José Doblado del Pino (1953-1954), Don Antonio Martín Notario (1954-1957), Don Luis Valpuesta Cortés (1957-1962) y Don Francisco Barrueco (1962-1963) años en los que la Comunidad va preparando la celebración de las Bodas de Oro en 1964. Y siguieron Don Teodoro Nieto (1965-1969) y Don Siro Vázquez (1969-1971).

En los años cincuenta, el Colegio está compuesto por 5 aulas de Enseñanza Primaria y con un número aproximado de unos 300 alumnos. El Bachillerato estaba compuesto por 1 aula de Ingreso y seis de Bachillerato (1º a 6º) y con unos 400 alumnos.

A mediados de los años sesenta se crea el Patronato San Francisco de Sales, aumentándose en el número de aulas.

A partir de la década de los setenta y hasta la celebración del 75 aniversario, los directores que han pasado por este Colegio fueron Don José Alba Montesinos (1971- 1972), Don José López Verdugo (1972-1975), Don Luis Martín Valverde (1975-1978), Don José Manuel Martín Martín (1978-1981), Don Antonio Rodríguez (1981-1987) y Don Miguel Moreno Gutiérrez (1987- 1996).

En el año 1970 el Centro se transforma, llega la Educación General Básica, desapareciendo, conforme se van implantando los cursos de E.G.B., el Bachillerato y el Internado. Se construye el edificio nuevo, obras que comenzaron en tiempos de Don Teodoro Nieto García. Desde entonces el funcionamiento es como un Centro subvencionado de tipo «A».

En el año 1986 se pasa de «Subvencionado» a «Concertado », es decir la Junta asume las competencias en materia de Educación y se firman los Conciertos con la Junta.

El Colegio se convierte en Centro mixto en el curso escolar 1987/88 en el que ingresan por primera vez 19 niñas en 1º de E.G.B.

El acontecimiento más importante durante este último período en la casa de Alcalá ha sido la conmemoración del setenta y cinco aniversario de su fundación, en 1989, y la concesión de la Medalla de Oro de la Ciudad a la comunidad salesiana por parte del Excelentísimo Ayuntamiento de Alcalá de Guadaíra en 1990. La familia Belloc se inclinó por una fundación dedicada a la enseñanza y educación de los niños de Alcalá El colegio se convierte en mixto en el curso 1987/88 en el que ingresan por primera vez 19 niñas en 1º de EGB.

En el curso 1987/88 es destinado a este Centro, como Director, Don Miguel Moreno Gutiérrez (1987/1996). Son años de cambios estructurales y de funcionamiento.

Durante su mandato se crean las aulas de Mecanografía, Idiomas, Informática, Audiovisuales, Coordinación de  Pastoral, Salas de reuniones, ampliación de Biblioteca. Se ejecutan obras de reforma en muros que dan a la Capilla. Se construyen los aseos que darán servicio a las recién incorporadas alumnas. Se limpia y restaura el retablo de la Capilla. En este período se realiza la pintura del Retablo, obra del pintor alcalareño y Antiguo Alumno de esta Casa, Isidoro Villalba Corzo.

Se implantan la Actividades Extraescolares.

Con motivo de las obras de restauración del Salón Gutiérrez de Alba de nuestra Ciudad, se ceden las instalaciones del Teatro del Colegio, que durante el período que duraron las obras, es el único local donde se puede proyectar Cine en nuestra Ciudad.

En el año 1990, la Hermandad Salesiana del Rosario, la Hermandad del Colegio, celebras sus Bodas Plata Fundacionales.

En el curso escolar 1994/95 se adelanta la Reforma en nuestro Centro implantándose la E.S.O. (Ley 1/90 de 3 de Octubre, LOGSE). Para ello y con fecha 1º de Marzo de 1992 se entregan los planos para la adaptación del Centro a la Educación Primaria y Secundaria. Después de acometer distintas obras de transformación y adaptación se entrega en la Delegación Provincial de Educación la solicitud de apertura y funcionamiento después de haber transformado-construido cuatro nuevas aulas, un laboratorio, sala de Profesores, despacho de Tutoría, un aula de Tecnología, vestuarios y servicios independientes para alumnos/as, gimnasio cubierto, aula/taller de fotografía, almacenes, servicios de minusválidos, rampas de acceso, etc., solicitud que se entrega el 2 de Julio de 1997.

Por Orden de 25 de Febrero de 1998 (BOJA de 26/03/1998) de la Junta de Andalucía concede autorización al Colegio Salesiano para apertura y funcionamiento de:

a.- Centro de Educación Primaria «Nuestra Señora del Aguila» para 12 unidades

b.- Centro de Educación Secundaria «Nuestra Señora del Águila» para 8 unidades.

En el Curso 1996/97, Don Fernando Báñez Martín (1996-2000) es nombrado Director del Colegio, convirtiéndose así en el Primer Alcalareño Hijo de Don Bosco, que dirige el mismo.

Continúa la labor de adecuación a los nuevos retos que demanda el nuevo modelo educativo. Se realizan trabajos de reformas y pintado del Colegio, se renueva el mobiliario escolar, despachos… Se sustituye la carpintería en las puertas que dan acceso a las aulas del patio de María Auxiliadora. Se informatizan despachos y jefaturas de estudios.

Se establece el sistema de formación continua para el profesorado, se realizan cursos formativos en distintos períodos del año.

A Don Fernando le sustituye en el curso escolar 2000/2001, Don J. Carmelo Pulido Morales (2000-2002) que realiza una labor de continuidad en estos dos años encaminados a seguir asentando los pilares básicos dentro de la organización y estructuras educativas del centro así como seguir llevando a cabo labores de conservación y mantenimiento.

En el curso escolar 2002/01, regresa a esta casa Don Fernando Báñez (2002-2007). Período en el que el Centro comienza e experimentar una notable transformación. En el año 2003, comienzan las obras de adecuación de aulas para la implantación de Educación Infantil.

Las aulas se dotan con aseos interiores, mobiliario, equipos informáticos y equipamiento didáctico. En el curso escolar 2004/2005 comienzan las clases para los alumnos de 3, 4 y 5 años en régimen privado. En el curso escolar 2005/06, según L.O. 10/2002, se conciertan las primeras unidades. Completándose así la oferta educativa.

Se amplía el aula de informática, dotándola de 30 puestos informáticos.

En el curso escolar 2004/2005, por acuerdo del Consejo Escolar, se implanta el uso del Uniforme Escolar.

En el año 2005, el Centro comienza a trabajar para implantar un Sistema de Gestión de Calidad. En septiembre de 2007, consigue la Certificación de Calidad, conforme con los requisitos de la Norma UNE-En-ISO 9001. Convirtiéndose así, en el primer Centro Educativo de Alcalá que consigue esta Certificación.

Comienzan las obras de adecuación del Comedor Escolar.

En el Curso 2007/2008, es destinado a este Centro, como director del mismo, Don Gustavo Martagón Ruiz (2007-2012), alcalareño igualmente.

Durante este primer curso comienza a prestarse el servicio de Comedor Escolar. Se realizan obras de reforma de los aseos de los alumnos.

En estos años se continúa trabajando en sistema de Calidad. Se amplía la oferta de formación del profesorado.

El Centro cuenta desde el curso escolar 2009/10, con aula de Apoyo a la Integración. En estos años, se introducen planes de mejora encaminados a ir añadiendo valor a los distintos aspectos y estructuras educativas del centro.

En el curso escolar 2008/09 se realiza la primera experiencia de inmersión lingüística realizándose un intercambio con alumnos de un centro suizo para mejorar en el idioma francés, esta misma experiencia se repite un año después con un centro de la localidad francesa de Arras.

Durante el curso 2010/11 el centro sigue caminando en proyectos de inmersión lingüística, en este caso en el idioma de inglés, en el que los alumnos seguirán un curso de una semana de duración en la localidad de Peterborough.

Se dotan de medios informáticos y audiovisuales algunas de las aulas del Centro. Se dotan de sistemas informáticos las salas de profesores. Se realizan trabajos de reforma en patios y zonas exteriores. Se Cambia la instalación eléctrica de todo el centro. Se dota de sistema wifi todo el espacio del mismo.

A partir de este año 2010, el Centro comienza su transformación de cara a la celebración de su primer Centenario de presencia en nuestra Ciudad. Se realizan cambios en el uso de los distintos espacios: Salas de profesores, Aulas de Apoyo, Despachos de Dirección, Administración, Conserjería…